Frederick giftet seg med Magdalene Sibylle of Saxe-Weissenfels 14 Nov 1669, Halle, Saxony-Anhalt, Germany. Magdalene (datter av Duke Augustus of Saxe-Weissenfels og Anna Maria of Mecklenburg-Schwerin) ble født 2 Sep 1648 , Halle, Saxony-Anhalt, Germany; døde 7 Jan 1681, Gotha, Thuringia, Germany. [Gruppeskjema] [Familiediagram]

1. Anna Sophie of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 22 Des 1670 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 28 Des 1728, Rudolstadt, Thuringia, Germany.
2. Magdalene Sibylle of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 30 Sep 1671 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 2 Mar 1673, Altenburg, Thuringia, Germany.
3. Dorothea Marie of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 22 Jan 1674 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 18 Apr 1713, Meiningen, Thuringia, Germany.
4. Fredericka of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 24 Mar 1675 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 28 Mai 1709, Karlsbad, Baden-Württemberg, Germany.
5. Duke Frederick II of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 28 Jul 1676 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 23 Mar 1732, Altenburg, Thuringia, Germany.
6. General Imperial Johann Wilhelm of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 4 Okt 1677 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 15 Aug 1707, Toulon, France.
7. Elisabeth of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 7 Feb 1679 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 22 Jun 1680, Gotha, Thuringia, Germany.
8. Johanna of Saxe-Gotha-Altenburg ble født 1 Okt 1680 , Gotha, Thuringia, Germany; døde 9 Jul 1704, Neustrelitz, Mecklenburg-Vorpommern, Germany.